Alors que la piste de Sépang s'asséchait, le pilote Repsol Honda Dani Pedrosa y est allé d'un dernier effort pour finalement obtenir la pôle position en marge du Grand Prix de Malaysie de MotoGP qui sera disputé demain. Le champion en titre Valentino Rossi (Yamaha) détenait jusque-là le meilleur temps et il ne fut pas en mesure de revenir en piste afin de regagner sa position face à Pedrosa. Le coéquipier de Rossi, Jorge Lorenzo, qui a démontré qu'il était véloce lors des essais du vendredi, a obtenu le 3e rang. Nicky Hayden (Honda) a réalisé le 4e temps devant Colin Edwards(Yamaha) qui avait longtemps inscrit le meilleur temps de la séance.
Grille de départ: Pos Pilote Temps Temps1. Dani Pedrosa Honda (B) 2:01.5482. Valentino Rossi Yamaha (B) 2:01.957 + 0.4093. Jorge Lorenzo Yamaha (M) 2:02.171 + 0.6234. Nicky Hayden Honda (M) 2:02.192 + 0.6445. Colin Edwards Yamaha (M) 2:02.245 + 0.6976. Andrea Dovizioso Honda (M) 2:02.836 + 1.2887. Casey Stoner Ducati (B) 2:02.953 + 1.4058. Loris Capirossi Suzuki (B) 2:03.078 + 1.5309. Randy de Puniet Honda (M) 2:03.110 + 1.56210. John Hopkins Kawasaki (B) 2:03.184 + 1.63611. Chris Vermeulen Suzuki (B) 2:03.271 + 1.72312. James Toseland Yamaha (M) 2:03.282 + 1.73413. Anthony West Kawasaki (B) 2:02.392 + 1.84414. Marco Melandri Ducati (B) 2:03.835 + 2.28715. Shinya Nakano Honda (B) 2:04.001 + 2.45316. Sylvain Guintoli Ducati (B) 2:04.378 + 2.83017. Alex de Angelis Honda (B) 2:04.679 + 3.13118. Nobuatsu Aoki Suzuki (B) 2:04.835 + 3.28719. Toni Elias Ducati (B) 2:05.120 + 3.572
Grille de départ: Pos Pilote Temps Temps1. Dani Pedrosa Honda (B) 2:01.5482. Valentino Rossi Yamaha (B) 2:01.957 + 0.4093. Jorge Lorenzo Yamaha (M) 2:02.171 + 0.6234. Nicky Hayden Honda (M) 2:02.192 + 0.6445. Colin Edwards Yamaha (M) 2:02.245 + 0.6976. Andrea Dovizioso Honda (M) 2:02.836 + 1.2887. Casey Stoner Ducati (B) 2:02.953 + 1.4058. Loris Capirossi Suzuki (B) 2:03.078 + 1.5309. Randy de Puniet Honda (M) 2:03.110 + 1.56210. John Hopkins Kawasaki (B) 2:03.184 + 1.63611. Chris Vermeulen Suzuki (B) 2:03.271 + 1.72312. James Toseland Yamaha (M) 2:03.282 + 1.73413. Anthony West Kawasaki (B) 2:02.392 + 1.84414. Marco Melandri Ducati (B) 2:03.835 + 2.28715. Shinya Nakano Honda (B) 2:04.001 + 2.45316. Sylvain Guintoli Ducati (B) 2:04.378 + 2.83017. Alex de Angelis Honda (B) 2:04.679 + 3.13118. Nobuatsu Aoki Suzuki (B) 2:04.835 + 3.28719. Toni Elias Ducati (B) 2:05.120 + 3.572